簡(jiǎn)要描述:SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態(tài),是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)。一般來(lái)說(shuō),SNP在人基因組中的發(fā)生頻率比較高,大約平均每1000個(gè)堿基中就有一個(gè)多態(tài)位點(diǎn),是繼微衛(wèi)星之后的第三代遺傳標(biāo)記。SNP廣泛用于群體遺傳學(xué)研究(如生物的起源、進(jìn)化及遷移等方面)和疾病相關(guān)基因的研究,在藥物基因?qū)W、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中起重要作用。
SNP(single nucleotide polymorphism)原理
SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態(tài),是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)。一般來(lái)說(shuō),一個(gè)SNP位點(diǎn)只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發(fā)生頻率比較高,大約平均每1000個(gè)堿基中就有一個(gè)多態(tài)位點(diǎn),是繼微衛(wèi)星之后的第三代遺傳標(biāo)記。有些SNP位點(diǎn)還會(huì)影響基因的功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變甚至致病。SNP廣泛用于群體遺傳學(xué)研究(如生物的起源、進(jìn)化及遷移等方面,將逐漸取代微衛(wèi)星而成為新一代的分子生物學(xué)標(biāo)記)和疾病相關(guān)基因的研究,在藥物基因組學(xué)、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中起重要作用。
Multiplex SNaPshot SNP分型法
SNaPshot SNP分型法
是基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的分型技術(shù),也稱小測(cè)序,主要針對(duì)中等通量的SNP分型項(xiàng)目。在一個(gè)含有測(cè)序酶、四種熒光標(biāo)記ddNTP、緊臨多態(tài)位點(diǎn)5’-端的不同長(zhǎng)度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中,引物延伸一個(gè)堿基即終止,經(jīng)ABI測(cè)序儀檢測(cè)后,根據(jù)峰的移動(dòng)位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn),根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型。對(duì)于PCR產(chǎn)物模板可通過(guò)多重PCR反應(yīng)體系來(lái)獲得。通常用于10-30個(gè)SNP位點(diǎn)分析。
SNaPshot SNP分型法服務(wù)流程
1. 客戶提供:
1).已純化基因組DNA,并填寫(xiě)詳細(xì)基因組DNA量,濃度及純度
2).或提供新鮮的組織,血液,細(xì)胞樣本;且盡量多的材料
3).提供已知的基因序列或物種基因序列號(hào);盡可能詳細(xì)的背景資料。
2.設(shè)計(jì)PCR 擴(kuò)增含SNPs 位點(diǎn)的一段DNA序列。
3.對(duì)PCR 產(chǎn)物進(jìn)行純化(去除引物和dNTP)。
4.引物延伸。
5.延伸產(chǎn)物測(cè)序。
6.提供:峰圖文件(abl.格式),序列文件(seq.格式);正式的數(shù)據(jù)分析報(bào)告。
樣本運(yùn)輸:
客戶根據(jù)溫度,所在區(qū)域及樣本類型的差異,以加冰袋或干冰運(yùn)輸,并保證樣本的密封性和完整性,以免造成不必要的污染和損耗。